O Laboratório de Microscopia da FAESA atende ao curso de Ciências Biológicas. O espaço é composto de 3 salas, com equipamentos para atender até 54 alunos, com 25 aparelhos de microscópio, 22 lupas e 20 caixas de Skinner.
Tem ainda uma coleção didática com mais de 300 espécies entre peixes, anfíbios, aves, mamíferos e invertebrados e uma coleção de crânios.
